従来のホワイトニングは、ホワイトニングのお薬で歯を溶かすことで、歯の表面を凸凹にし、そこに当たった光が乱反射することで歯を白く見せていました。

そのため、ホワイトニングを行い、ある一定の時間が経過すると、歯のくぼんだ部分に着色が付いてしまいます。

しかもこの着色は歯のくぼんでいる部分についているために、PMTCをしても着色を除去するのが困難となるのです。

また、着色するようなものを極力控えたとしても、だ液の働きで徐々に表面性状が修復され、乱反射が起こらなくなっていきます。従って、短期間で定期的にホワイトニングを繰り返し行い、着色部分もお薬で溶かす必要があるとされてきました。

一方、FAPホワイトニングですが、ホワイトニングと同時に（元々存在する微小な歯の亀裂などに）歯の結晶成分と云われるハイドロキシアパタイトを強化したもの（フルオロアパタイト、強化カルシウム）を化学的に歯に結合させていくというメカニズムです。

つまり、「虫歯予防のフッ素」と「歯のハイドロキシアパタイト」が反応してできる『フルオロアパタイト』そのものを直接歯の表面に結合させるのです。

（イメージとしては、今流行のナノテクに近いかもしれません。）

従来のホワイトニングと異なり、表面を凸凹にするのではなく、つるつるな表面にするわけですから、歯を強くしながら、白く輝く歯にすることができるということになります。